2016年困难重重，集团在各个市场都遇到挑战。同时，集团在2016年决定进行全面改革，马士基集团将成为一个专注于集装箱航运、物流和港口业务的公司，实现营收增长。
    马士基集团发布2016年全年财报。数据显示，马士基集团2016年报告利润亏损19亿美元（2015年盈利9.25亿美元），业绩不尽如人意，这主要因为马士基石油钻探资产减值14亿美元（2015年同期2700万美元）、马士基供给服务资产减值12亿美元（2015年0美元），因此总体税后资产减值达28亿美元（2015年26亿美元）。集团2016年实际利润为7.11亿美元（2015年31亿美元），与2016年11月份所宣布的业绩预期保持一致。投资资本回报率为-2.7%（2015年为2.9%），可支配现金流为-2900万美元（2015年为66亿美元，包括出售丹斯克银行股权49亿美元）。
    马士基集团2016年实际利润为7.11亿美元，尽管与预期保持一致，但该业绩并不尽如人意。2016年的实际利润主要受到马士基航运亏损的影响。由于严重的供给过剩以及市场长期需求预期降低，马士基石油钻探和马士基供给服务资产减值共27亿美元，这导致马士基集团2016年报告利润亏损19亿美元。
    在2016年上半年，货物运输需求增长低于预期，导致运价遭遇显著的下行压力。在2016年下半年，尤其是第四季度，需求有所增长，新增运力投放减缓，因此运价有所回升。2016年艰难的业务环境促进了行业整合，导致一家主要集装箱航运公司从行业中退出。马士基码头在过去几年在全球、尤其是新兴市场和主要依赖石油发展的市场拓展了码头服务网络，但由于集装箱航运业的整合及充满挑战的油价环境，导致马士基码头营收下滑。
    在过去几年，石油产业持续进行大规模的成本减缩，大量项目取消，同时有大量的新增运力投放，因此，尽管马士基石油钻探和马士基供给服务推行了许多成本优化举措，公司业绩仍旧受到严重影响。考虑到市场环境充满挑战，马士基石油钻探和马士基供给服务分别进行了资产减值（马士基石油钻探税前资产减值15亿美元，占投资资本和新订造合同价值的18%；马士基供给服务税前资产减值12亿美元，占投资资本和新订造项目合同价值的44%）。马士基油轮业绩表现、合同覆盖及成本节约情况有所改善，部分抵消了运费降低带来的不利影响。根据集团新战略，集团旗下所有的石油及石油相关业务将准备从马士基集团剥离。